Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Parp1P11103 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp1P11103 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp1P11103 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp1P11103 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Parp1P11103 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms