Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccl3P10855 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms