Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
P10404 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
P10404 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
P10404 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
P10404 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P10404 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
P10404 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P10404 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P10404 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P10404 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
P10404 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P10404 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms