Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Amd1P0DMN7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Amd1P0DMN7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms