Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
UbbP0CG49 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
UbbP0CG49 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms