Protein–RNA interactions for Protein: P0C872

Jmjd7, JmjC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd7P0C872 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd7P0C872 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd7P0C872 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms