Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxc9P09633 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hoxc9P09633 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms