Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Itgb1P09055 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itgb1P09055 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms