Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Csf1P07141 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf1P07141 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Csf1P07141 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms