Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoa4P06728 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoa4P06728 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms