Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxa7P02830 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa7P02830 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa7P02830 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms