Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01638 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01638 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01638 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01638 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01638 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01638 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms