Protein–RNA interactions for Protein: P01637

Ig kappa chain V-V region T1, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01637 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01637 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01637 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01637 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01637 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01637 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01637 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01637 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01637 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01637 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01637 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01637 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01637 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms