Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ifnb1P01575 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms