Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl20O89093 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl20O89093 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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