Protein–RNA interactions for Protein: O88951

Lin7b, Protein lin-7 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7bO88951 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lin7bO88951 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lin7bO88951 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms