Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcnkO88874 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CcnkO88874 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CcnkO88874 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CcnkO88874 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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CcnkO88874 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CcnkO88874 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CcnkO88874 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CcnkO88874 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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