Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ComtO88587 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ComtO88587 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ComtO88587 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ComtO88587 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ComtO88587 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ComtO88587 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ComtO88587 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ComtO88587 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ComtO88587 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ComtO88587 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ComtO88587 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ComtO88587 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms