Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cops6O88545 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cops6O88545 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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