Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CntfrO88507 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CntfrO88507 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
CntfrO88507 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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