Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nme6O88425 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms