Protein–RNA interactions for Protein: O70191

Atf5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf5O70191 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atf5O70191 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atf5O70191 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atf5O70191 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf5O70191 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf5O70191 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atf5O70191 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms