Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChkbO55229 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ChkbO55229 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ChkbO55229 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ChkbO55229 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ChkbO55229 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms