Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Supt5hO55201 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Supt5hO55201 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
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