Protein–RNA interactions for Protein: O55186

Cd59a, CD59A glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd59aO55186 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd59aO55186 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd59aO55186 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd59aO55186 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd59aO55186 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cd59aO55186 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd59aO55186 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cd59aO55186 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms