Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp2a2O55143 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms