Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpl35aO55142 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpl35aO55142 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rpl35aO55142 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rpl35aO55142 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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