Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Eif6O55135 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms