Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nipsnap1O55125 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nipsnap1O55125 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms