Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dsg2O55111 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms