Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PrxO55103 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrxO55103 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrxO55103 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrxO55103 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrxO55103 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrxO55103 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PrxO55103 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrxO55103 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrxO55103 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrxO55103 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrxO55103 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrxO55103 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrxO55103 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrxO55103 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PrxO55103 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrxO55103 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrxO55103 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrxO55103 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrxO55103 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrxO55103 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PrxO55103 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrxO55103 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrxO55103 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrxO55103 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrxO55103 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrxO55103 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrxO55103 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrxO55103 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PrxO55103 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrxO55103 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrxO55103 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrxO55103 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrxO55103 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrxO55103 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrxO55103 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrxO55103 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrxO55103 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrxO55103 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrxO55103 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrxO55103 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrxO55103 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PrxO55103 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrxO55103 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrxO55103 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrxO55103 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrxO55103 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms