Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Bnip3O55003 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bnip3O55003 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms