Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlkO54988 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SlkO54988 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SlkO54988 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SlkO54988 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SlkO54988 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SlkO54988 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SlkO54988 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SlkO54988 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SlkO54988 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SlkO54988 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SlkO54988 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SlkO54988 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms