Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema6bO54951 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema6bO54951 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema6bO54951 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms