Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Csnk2a2O54833 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Csnk2a2O54833 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms