Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffbO54788 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffbO54788 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffbO54788 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffbO54788 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffbO54788 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffbO54788 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffbO54788 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffbO54788 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffbO54788 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DffbO54788 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
DffbO54788 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DffbO54788 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DffbO54788 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
DffbO54788 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DffbO54788 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DffbO54788 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DffbO54788 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffbO54788 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffbO54788 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DffbO54788 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffbO54788 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffbO54788 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffbO54788 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DffbO54788 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms