Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DffaO54786 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DffaO54786 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
DffaO54786 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DffaO54786 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DffaO54786 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DffaO54786 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DffaO54786 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DffaO54786 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DffaO54786 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DffaO54786 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms