Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EdaO54693 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EdaO54693 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EdaO54693 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EdaO54693 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EdaO54693 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EdaO54693 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EdaO54693 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EdaO54693 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EdaO54693 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EdaO54693 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EdaO54693 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms