Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FxnO35943 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FxnO35943 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FxnO35943 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FxnO35943 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FxnO35943 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FxnO35943 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FxnO35943 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FxnO35943 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FxnO35943 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FxnO35943 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms