Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nek2O35942 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nek2O35942 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms