Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pik3cdO35904 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pik3cdO35904 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms