Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ppfibp2O35711 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ppfibp2O35711 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ppfibp2O35711 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms