Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NudcO35685 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NudcO35685 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NudcO35685 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NudcO35685 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NudcO35685 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NudcO35685 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NudcO35685 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NudcO35685 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NudcO35685 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NudcO35685 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NudcO35685 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NudcO35685 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NudcO35685 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NudcO35685 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NudcO35685 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NudcO35685 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NudcO35685 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NudcO35685 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NudcO35685 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NudcO35685 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NudcO35685 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NudcO35685 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NudcO35685 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NudcO35685 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NudcO35685 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms