Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Stag2O35638 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Stag2O35638 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Stag2O35638 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms