Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clk3O35492 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Clk3O35492 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk3O35492 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk3O35492 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Clk3O35492 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms