Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atf6bO35451 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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