Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prrt1O35449 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prrt1O35449 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms