Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dgcr6O35347 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Dgcr6O35347 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms