Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Kpna3O35344 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Kpna3O35344 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms