Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srsf5O35326 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srsf5O35326 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms